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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3j31Q_ | PDB header: virus | Chain: Q: PDB Molecule: a223 penton base; | PDBTitle: life in the extremes: atomic structure of sulfolobus turreted2 icosahedral virus |
Added to library: Sat May 4 08:46:19 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | V | F | K | E | V | K | E | K | F | E | R | Y | K | F | D | V | V | Y | V | D | R | E | Y | P | V | S | S | N | N | L | N | V | F | F | E | I | G | E | R | N | S | F | S | G | L | L | I | N | E | G | Q | A | V | I | D | V | L | L | L | K | K | S | H | E | G | L | S | P | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | B | T | T | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | P | G | E | G | T | G | I | Q | L | S | A | G | Q | I | L | K | F | Y | N | V | P | I | A | E | I | I | V | E | Y | D | P | S | N | V | S | G | V | S | S | N | V | K | L | K | G | T | I | H | P | L | F | E | V | P | S | Q | I | S | I | E | N | F | Q | P | T | E | N | Y | L | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | T | T | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Y | S | G | F | G | T | S | L | P | Q | T | Y | T | I | P | A | N | G | Y | L | I | I | S | I | T | N | T | S | T | G | N | I | G | Q | I | T | L | T | I | G | S | T | T | M | T | F | N | L | Q | T | G | E | N | K | I | P | V | I | A | G | T | Q | I | T | N | L | T | L | T | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | S | S | A | I | L | I | Y | E | E | V | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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