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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3j20A_ | PDB header: ribosome | Chain: A: PDB Molecule: 30s ribosomal protein s3ae; | PDBTitle: promiscuous behavior of proteins in archaeal ribosomes revealed by2 cryo-em: implications for evolution of eukaryotic ribosomes (30s3 ribosomal subunit) |
Added to library: Wed Jan 9 19:41:09 2013 | |
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Sequence | T | R | D | K | W | K | L | K | Q | W | Y | I | I | Y | A | P | D | F | F | G | G | V | E | V | G | L | T | P | A | D | D | P | E | K | V | L | N | R | V | V | E | V | T | L | K | D | V | T | G | D | F | T | K | S | H | V | K | L | Y | F | Q | V | Y | D | V | K | G | Q | N | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Y | T | K | F | K | G | M | K | L | A | R | S | Y | I | R | S | L | V | R | R | K | T | T | R | I | D | G | I | F | N | I | T | T | K | D | G | Y | K | L | R | V | M | A | M | A | I | A | M | R | R | I | Q | T | S | Q | E | R | A | I | R | K | I | M | Q | E | I | I | Y | K | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | ||||||||||
Sequence | A | E | E | L | N | F | K | D | F | V | L | E | S | V | N | G | K | I | A | A | E | I | A | K | E | A | K | K | I | Y | P | L | R | K | A | E | I | R | K | I | K | V | L | E | E | P | Q | V | I | A | ||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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