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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3j1uA_ | PDB header: motor protein/structural protein | Chain: A: PDB Molecule: cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1, seryl t-rna synthetase | PDBTitle: low affinity dynein microtubule binding domain - tubulin complex |
Added to library: Sat Sep 29 15:11:31 2012 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | K | Q | Q | E | V | I | A | D | K | Q | M | S | V | K | E | D | L | D | K | V | E | P | A | V | I | E | A | Q | N | A | V | K | S | I | K | K | Q | H | L | V | E | V | R | S | M | A | N | P | P | A | A | V | K | L | A | L | E | S | I | C | L | L | L | G | E | S | T | T | D | W |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | Q | I | R | S | I | I | M | R | E | N | F | I | P | T | I | V | N | F | S | A | E | E | I | S | D | A | I | R | E | K | M | K | K | N | Y | M | S | N | P | S | Y | N | Y | E | I | V | N | R | A | S | L | A | C | G | P | M | V | K | W | A | I | A | Q | L | N | Y | A | D | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | G | T | T | T | T | T | T | S | T | T | T | G | G | G | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||
Sequence | L | K | R | V | E | P | L | R | N | E | L | Q | K | L | E | D | D | A | K | D | N | Q | Q | K | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | - |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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