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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3iusB_ | PDB header: structural genomics, unknown function | Chain: B: PDB Molecule: uncharacterized conserved protein; | PDBTitle: the structure of a functionally unknown conserved protein2 from silicibacter pomeroyi dss |
Added to library: Sat Aug 28 17:00:26 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | G | T | L | L | S | F | G | H | G | Y | T | A | R | V | L | S | R | A | L | A | P | Q | G | W | R | I | I | G | T | S | R | N | P | D | Q | X | E | A | I | R | A | S | G | A | E | P | L | L | W | P | G | E | E | P | S | L | D | G | V | T | H | L | L | I | S | T | A | P | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | G | G | G | T | S | G | G | G | T | T | S | T | T | T | S | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | G | G | D | P | V | L | A | A | L | G | D | Q | I | A | A | R | A | A | Q | F | R | W | V | G | Y | L | S | T | T | A | V | Y | G | D | H | D | G | A | W | V | D | E | T | T | P | L | T | P | T | A | A | R | G | R | W | R | V | X | A | E | Q | Q | W | Q | A | V | P | N | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | T | G | G | G | S | G | G | G | S | T | T | T | T | S | S | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | P | L | H | V | F | R | L | A | G | I | Y | G | P | G | R | G | P | F | G | G | I | R | R | I | I | K | P | G | Q | V | F | S | R | I | H | V | E | D | I | A | Q | V | L | A | A | S | X | A | R | P | D | P | G | A | V | Y | N | V | C | D | D | E | P | V | P | P | Q | D | V | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | B | S | T | T | B | S | T | T | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | A | Y | A | A | E | L | Q | G | L | P | L | P | P | A | V | D | F | D | K | A | D | L | T | P | X | A | R | S | F | Y | S | E | N | K | R | V | R | N | D | R | I | K | E | E | L | G | V | R | L | K | Y | P | N | Y | R | V | G | L | E | A | L | Q | A | D | A | E | T | |||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | T | T | T | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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