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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3in1A_ | PDB header: transferase | Chain: A: PDB Molecule: uncharacterized sugar kinase ydjh; | PDBTitle: crystal structure of a putative ribokinase in complex with2 adp from e.coli |
Added to library: Sun Aug 29 10:10:43 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | N | L | D | V | I | C | I | G | A | A | I | V | D | I | P | L | Q | P | V | S | K | N | I | F | D | V | D | S | Y | P | L | E | R | I | A | X | T | T | G | G | D | A | I | N | E | A | T | I | I | S | R | L | G | H | R | T | A | L | X | S | R | I | G | K | D | A | A | G | Q | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | G | G | G | S | S | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | L | D | H | C | R | K | E | N | I | D | I | Q | S | L | K | Q | D | V | S | I | D | T | S | I | N | V | G | L | V | T | E | D | G | E | R | T | F | V | T | N | R | N | G | S | L | W | K | L | N | I | D | D | V | D | F | A | R | F | S | Q | A | K | L | L | S | L | A | S | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | B | T | T | T | T | S | T | T | S | T | T | S | G | G | G | G | G | G | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | F | N | S | P | L | L | D | G | K | A | L | T | E | I | F | T | Q | A | K | A | R | Q | X | I | I | C | A | D | X | I | K | P | R | L | N | E | T | L | D | D | I | C | E | A | L | S | Y | V | D | Y | L | F | P | N | F | A | E | A | K | L | L | T | G | K | E | T | L | D | E | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | T | T | T | S | S | S | G | G | G | G | T | T | S | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | A | D | C | F | L | A | C | G | V | K | T | V | V | I | K | T | G | K | D | G | C | F | I | K | R | G | D | X | T | X | K | V | P | A | V | A | G | I | T | A | I | D | T | I | G | A | G | D | N | F | A | S | G | F | I | A | A | L | L | E | G | K | N | L | R | E | C | A | R | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | G | G | G | T | T | S | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | ||||||||||||||||||||||
Sequence | A | N | A | T | A | A | I | S | V | L | S | V | G | A | T | T | G | V | K | N | R | K | L | V | E | Q | L | L | E | E | Y | E | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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