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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3iehA_ | PDB header: hydrolase | Chain: A: PDB Molecule: putative metallopeptidase; | PDBTitle: crystal structure of putative metallopeptidase (yp_001051774.1) from2 shewanella baltica os155 at 2.45 a resolution |
Added to library: Wed Jan 9 16:50:19 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | R | S | P | F | E | S | F | Q | W | K | S | D | I | F | N | C | E | S | T | D | I | D | N | F | Y | L | L | L | E | Q | E | X | T | R | L | G | X | V | E | K | N | L | G | E | V | G | K | Y | K | V | S | L | Y | Q | S | P | A | A | K | S | G | L | P | S | L | L | I | S | A | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | F | H | G | E | E | S | A | G | P | W | G | L | L | H | F | L | S | E | A | S | A | D | L | F | E | R | V | N | L | S | L | L | P | L | V | N | P | T | G | F | S | R | G | H | R | F | N | K | Y | G | E | N | P | N | R | G | F | V | F | E | N | G | K | P | K | A | N | E | H | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | G | G | G | G | G | T | S | T | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | V | E | G | K | L | L | L | D | H | A | Q | L | L | I | A | A | C | R | D | G | I | L | T | C | H | E | D | V | L | S | R | E | A | Y | V | Y | S | F | E | P | S | Q | V | P | G | R | F | S | L | D | L | R | D | T | L | G | G | Y | F | P | I | A | V | D | G | E | I | D | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | S | B | S | S | S | S | T | T | S | B | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | C | P | V | K | D | G | L | I | F | N | H | F | D | T | S | F | E | A | C | L | V | R | S | G | A | R | V | G | A | C | T | E | T | P | A | L | Q | N | F | D | Q | R | V | L | A | N | S | A | A | X | T | H | F | L | A | L | C | A | ||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | S | S | S | T | S | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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