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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3i4uA_ | PDB header: hydrolase | Chain: A: PDB Molecule: atp-dependent rna helicase dhx8; | PDBTitle: crystal structure analysis of a helicase associated domain |
Added to library: Sat Aug 28 19:22:36 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | S | P | M | E | T | L | I | T | A | M | E | Q | L | Y | T | L | G | A | L | D | D | E | G | L | L | T | R | L | G | R | R | M | A | E | F | P | L | E | P | M | L | C | K | M | L | I | M | S | V | H | L | G | C | S | E | E | M | L | T | I | V | S | M | L | S | V | Q | N | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | B | T | T | S | B | T | T | S | S | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | F | Y | R | P | K | D | K | Q | A | L | A | D | Q | K | K | A | K | F | H | Q | T | E | G | D | H | L | T | L | L | A | V | Y | N | S | W | K | N | N | K | F | S | N | P | W | C | Y | E | N | F | I | Q | A | R | S | L | R | R | A | Q | D | I | R | K | Q | M | L | G | I | M | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | G | G | G | T | T | B | T | T | B | T | T | T | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | R | H | K | L | D | V | V | S | C | G | K | S | T | V | R | V | Q | K | A | I | C | S | G | F | F | R | N | A | A | K | K | D | P | Q | E | G | Y | R | T | L | I | D | Q | Q | V | V | Y | I | H | P | S | S | A | L | F | N | R | Q | P | E | W | V | V | Y | H | E | L | V | L | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | G | G | G | S | S | S | S | T | T | T | T | T | S | T | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | |||||||||||||
Sequence | T | K | E | Y | M | R | E | V | T | T | I | D | P | R | W | L | V | E | F | A | P | A | F | F | K | V | L | D | H | G | L | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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