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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3i2wB_ | PDB header: endocytosis | Chain: B: PDB Molecule: syndapin; | PDBTitle: crystal structure of efc/f-bar domain of drosophila2 syndapin/pacsin |
Added to library: Sat Aug 28 17:25:45 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | D | S | F | W | E | P | G | N | Y | K | R | T | T | K | R | I | E | D | G | Y | K | L | C | N | D | L | Q | Q | L | I | Q | E | R | A | D | I | E | K | G | Y | A | K | S | L | R | T | W | S | K | K | W | G | E | L | I | E | K | G | P | E | Y | G | T | T | E | A | A | W | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | V | L | T | E | S | E | R | I | S | D | V | H | X | K | I | K | D | N | L | C | N | D | V | N | S | Q | I | K | T | W | Q | K | E | N | Y | H | H | T | L | X | Q | I | K | E | R | K | D | L | E | D | L | F | K | K | A | Q | K | P | W | A | K | L | L | A | K | V | E | K | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | K | A | D | Y | H | S | A | C | K | T | E | R | S | A | T | N | Q | E | R | N | A | N | A | D | S | S | L | S | P | D | Q | V | K | K | X | H | D | R | V | Q | K | T | K | D | Q | V | Q | K | C | R | E | K | Y | E | Q | A | I | A | E | I | T | K | Y | N | S | V | Y | I | E | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | X | T | S | V | F | E | K | C | Q | T | F | E | K | T | R | L | Q | F | F | K | E | I | L | F | N | V | H | S | C | L | D | L | T | K | V | Q | S | L | P | Q | I | Y | E | E | F | S | H | T | I | N | N | A | D | Q | Q | K | D | L | K | W | W | S | N | N | H | G | I | N | X | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | X | N | W | P | S | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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