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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3hzjB_ | PDB header: hydrolase activator | Chain: B: PDB Molecule: rab gtpase-activating protein 1-like; | PDBTitle: crystal structure of the rabgap domain of the rabgap1l2 protein |
Added to library: Sat Aug 28 20:35:44 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | L | S | T | L | V | K | S | G | V | P | E | A | L | R | A | E | V | W | Q | L | L | R | Y | R | I | L | I | T | K | D | S | A | Q | E | S | V | I | T | R | D | I | H | R | T | F | P | A | H | D | Y | F | K | D | T | G | G | D | G | Q | E | S | L | Y | K | I | C | K | A | Y | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | T | T | T | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | Y | D | E | D | I | G | Y | C | Q | G | Q | S | F | L | A | A | V | L | L | L | H | X | P | E | E | Q | A | F | C | V | L | V | K | I | X | Y | D | Y | G | L | R | D | L | Y | R | N | N | F | E | D | L | H | C | K | F | Y | Q | L | E | R | L | X | Q | E | Q | L | P | D | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | T | T | T | S | T | S | S | G | G | G | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | H | S | H | F | S | D | L | N | L | E | A | H | X | Y | A | S | Q | W | F | L | T | L | F | T | A | K | F | P | L | C | X | V | F | H | I | I | D | L | L | L | C | E | G | L | N | I | I | F | H | V | A | L | A | L | L | K | T | S | K | E | D | L | L | Q | A | D | F | E | G | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | T | S | T | T | T | T | T | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | |||||||
Sequence | L | K | F | F | R | V | Q | L | P | K | R | Y | R | A | E | E | N | A | R | R | L | X | E | Q | A | C | N | I | K | V | P | T | K | K | L | K | K | Y | E | K | E | Y | Q | T | X | R | ||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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