|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c3hnmD_ | PDB header: structural genomics, unknown function | Chain: D: PDB Molecule: putative chitobiase; | PDBTitle: crystal structure of protein bt_411 (putative chitobiase,2 fragment 298-461) from bacteroides thetaiotaomicron,3 northeast structural genomics consortium target btr319d |
Added to library: Sat Aug 28 18:43:01 2010 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | Y | T | V | K | F | Q | P | D | P | I | D | K | K | G | W | S | V | I | D | F | N | N | C | C | T | Q | D | G | G | W | Y | L | N | X | G | W | G | V | E | S | L | I | D | N | N | P | G | T | Q | W | L | C | R | W | D | V | K | E | P | L | P | Y | Y | F | V | F | D | X | G | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | G | G | G | S | S | T | T | T | T | T | T | S | G | G | G | T | T | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | Y | T | L | F | R | F | G | F | A | N | P | V | A | P | A | A | H | V | W | A | G | T | S | K | A | G | Y | V | E | A | S | I | D | N | E | N | W | V | K | L | K | D | W | T | S | P | K | I | G | E | P | N | V | N | X | D | V | P | A | T | Q | A | R | Y | I | R | F | V | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||
Sequence | T | D | T | Y | P | T | Y | D | G | L | R | V | S | L | G | E | V | Y | A | W | G | L | E | H | H | H | H | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|