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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3hl6B_ | PDB header: unknown function | Chain: B: PDB Molecule: pathogenicity island protein; | PDBTitle: staphylococcus aureus pathogenicity island 3 orf9 protein |
Added to library: Sun Aug 29 06:06:15 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | I | E | T | I | V | N | E | F | E | T | R | A | G | T | L | L | R | Y | Y | T | G | L | L | E | R | S | K | V | Q | P | C | C | F | K | L | Y | N | D | P | F | D | M | V | Y | V | M | M | N | S | K | L | F | S | H | V | Y | I | K | D | C | K | V | R | Q | S | F | E | L | A | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | S | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | P | K | H | T | E | G | L | I | R | S | I | E | G | H | Y | V | G | Y | E | L | H | D | G | K | Q | L | S | I | S | D | M | M | A | S | Q | L | F | E | D | E | Y | F | M | Y | G | L | Q | T | Y | A | S | S | N | T | D | V | I | A | N | I | E | M | L | Y | Q | L | A | T | G | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | ||||||||
Sequence | N | E | P | V | P | E | L | V | E | G | L | K | L | V | T | E | F | V | Q | D | E | N | A | T | Q | E | D | Y | K | A | L | E | R | K | L | N | D | L | K | A | S | Y | Y | S | L | S | K | L | A | A | A | L | ||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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