|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c3hkoA_ | PDB header: transferase | Chain: A: PDB Molecule: calcium/calmodulin-dependent protein kinase with | PDBTitle: crystal structure of a cdpk kinase domain from2 cryptosporidium parvum, cgd7_40 |
Added to library: Sun Aug 29 00:57:15 2010 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | L | Y | F | Q | G | G | S | L | L | E | L | Q | K | K | Y | H | L | K | G | A | I | G | Q | G | S | Y | G | V | V | R | V | A | I | E | N | Q | T | R | A | I | R | A | I | K | I | M | N | K | N | K | I | R | Q | K | D | V | E | R | I | K | T | E | V | R | L | M | K | K | L | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | H | P | N | I | A | R | L | Y | E | V | Y | E | D | E | Q | Y | I | C | L | V | M | E | L | C | H | G | G | H | L | L | D | K | L | N | V | F | I | D | D | S | T | G | K | C | A | M | D | V | V | K | T | Q | I | C | P | C | P | E | C | N | E | E | A | I | N | G | S | I | F | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | S | S | S | B | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | E | S | L | D | F | V | Q | R | E | K | L | I | S | N | I | M | R | Q | I | F | S | A | L | H | Y | L | H | N | Q | G | I | C | H | R | D | I | K | P | E | N | F | L | F | S | T | N | K | S | F | E | I | K | L | V | D | F | G | L | S | K | E | F | Y | K | L | N | N | G | A | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | S | S | S | S | T | T | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | T | P | Y | F | V | A | P | E | V | L | N | T | T | N | E | S | Y | G | P | K | C | D | A | W | S | A | G | V | L | L | H | L | L | L | M | G | A | V | P | F | P | G | V | N | D | A | D | T | I | S | Q | V | L | N | K | K | L | C | F | E | N | P | N | Y | N | V | L | S | P | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | S | S | S | T | S | S | S | S | S | S | T | T | S | G | G | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||
Sequence | A | R | D | L | L | S | N | L | L | N | R | N | V | D | E | R | F | D | A | M | R | A | L | Q | H | P | W | I | S | Q | F | S | D | K | I | Y | K | M | S | |||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | S | S | T | T | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|