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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3hahA_ | PDB header: endocytosis | Chain: A: PDB Molecule: human pacsin1 f-bar; | PDBTitle: crystal structure of human pacsin1 f-bar domain (c2 lattice) |
Added to library: Sat Aug 28 16:09:45 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | D | S | F | W | E | V | G | N | Y | K | R | T | V | K | R | I | D | D | G | H | R | L | C | N | D | L | M | N | C | V | Q | E | R | A | K | I | E | K | A | Y | G | Q | Q | L | T | D | W | A | K | R | W | R | Q | L | I | E | K | G | P | Q | Y | G | S | L | E | R | A | W | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | I | M | T | E | A | D | K | V | S | E | L | H | Q | E | V | K | N | N | L | L | N | E | D | L | E | K | V | K | N | W | Q | K | D | A | Y | H | K | Q | I | M | G | G | F | K | E | T | K | E | A | E | D | G | F | R | K | A | Q | K | P | W | A | K | K | M | K | E | L | E | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | B | T | T | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | K | K | A | Y | H | L | A | C | K | E | E | K | L | A | M | Q | D | K | V | D | K | C | K | Q | D | V | Q | K | T | Q | E | K | Y | E | K | V | L | E | D | V | G | K | T | T | P | Q | Y | M | E | N | M | E | Q | V | F | E | Q | C | Q | Q | F | E | E | K | R | L | V | F | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||
Sequence | K | E | V | L | L | D | I | K | R | H | L | N | L | A | E | N | S | S | Y | I | H | V | Y | R | E | L | E | Q | A | I | R | G | A | D | A | Q | E | D | L | R | W | F | R | S | T | S | G | P | G | M | P | M | N | W | P | Q | F | E | E | |||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | T | T | T | T | T | S | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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