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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3h2sA_ | PDB header: oxidoreductase | Chain: A: PDB Molecule: putative nadh-flavin reductase; | PDBTitle: crystal structure of the q03b84 protein from lactobacillus2 casei. northeast structural genomics consortium target3 lcr19. |
Added to library: Sat Aug 28 16:18:17 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | X | K | I | A | V | L | G | A | T | G | R | A | G | S | A | I | V | A | E | A | R | R | R | G | H | E | V | L | A | V | V | R | D | P | Q | K | A | A | D | R | L | G | A | T | V | A | T | L | V | K | E | P | L | V | L | T | E | A | D | L | D | S | V | D | A | V | V | D | A | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | S | T | T | T | S | G | G | G | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | V | P | W | G | S | G | R | G | Y | L | H | L | D | F | A | T | H | L | V | S | L | L | R | N | S | D | T | L | A | V | F | I | L | G | S | A | S | L | A | X | P | G | A | D | H | P | X | I | L | D | F | P | E | S | A | A | S | Q | P | W | Y | D | G | A | L | Y | Q | Y | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | T | T | G | G | G | S | B | T | T | S | S | G | G | G | G | G | G | G | G | G | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | E | Y | Q | F | L | Q | X | N | A | N | V | N | W | I | G | I | S | P | S | E | A | F | P | S | G | P | A | T | S | Y | V | A | G | K | D | T | L | L | V | G | E | D | G | Q | S | H | I | T | T | G | N | X | A | L | A | I | L | D | Q | L | E | H | P | T | A | I | R | D | R | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | B | S | S | B | T | T | S | B | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | V | V | R | D | A | D | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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