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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3gvzB_ | PDB header: structural genomics, unknown function | Chain: B: PDB Molecule: uncharacterized protein cv2077; | PDBTitle: crystal structure of the protein cv2077 from2 chromobacterium violaceum. northeast structural genomics3 consortium target cvr62 |
Added to library: Sat Aug 28 17:24:34 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | C | T | L | W | G | A | A | G | T | A | S | X | E | G | S | L | L | A | K | N | R | D | W | K | P | D | H | A | Q | S | L | R | L | L | H | P | E | H | G | Y | A | Y | L | G | L | Y | A | D | N | G | S | E | P | G | I | K | A | G | V | N | Q | K | G | L | A | V | V | A | A | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | B | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | S | S | L | P | R | A | L | R | G | V | L | T | R | L | L | R | D | Y | G | S | L | D | E | V | A | S | A | A | D | K | L | F | A | Q | A | R | P | V | F | L | L | L | A | D | A | G | G | L | X | Q | V | E | I | G | Q | H | G | R | Y | R | L | I | R | Q | Q | S | G | T | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | S | T | T | T | T | S | S | T | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | H | T | N | H | Y | A | D | T | S | L | L | D | G | A | Q | T | I | G | P | S | S | Q | A | R | L | E | R | I | R | F | L | L | D | Q | H | P | A | H | T | L | S | E | F | E | R | L | S | R | D | R | H | D | G | P | D | N | S | L | W | R | S | G | R | E | H | T | L | A | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | G | G | G | S | S | S | S | S | S | B | T | S | T | T | T | S | S | S | S | B | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . |
Sequence | W | R | I | A | L | P | A | G | A | P | P | R | L | Q | L | T | L | A | N | P | G | R | A | E | R | D | G | D | Y | A | L | D | S | A | F | W | A | Q | P | A | R | T | L | L | P | K | ||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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