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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3gpiA_ | PDB header: structural genomics, unknown function | Chain: A: PDB Molecule: nad-dependent epimerase/dehydratase; | PDBTitle: structure of putative nad-dependent epimerase/dehydratase2 from methylobacillus flagellatus |
Added to library: Sat Aug 28 19:58:33 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | L | S | K | I | L | I | A | G | C | G | D | L | G | L | E | L | A | R | R | L | T | A | Q | G | H | E | V | T | G | L | R | R | S | A | Q | P | M | P | A | G | V | Q | T | L | I | A | D | V | T | R | P | D | T | L | A | S | I | V | H | L | R | P | E | I | L | V | Y | C | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | S | T | T | T | T | G | G | G | T | T | G | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | A | S | E | Y | S | L | S | Y | V | E | G | L | R | N | T | L | S | A | L | E | G | A | P | L | Q | H | V | F | F | V | S | S | T | G | V | Y | G | Q | E | V | E | E | W | L | D | E | D | T | P | P | I | A | K | D | F | S | G | K | R | M | L | E | A | E | A | L | L | A | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | S | G | G | G | S | S | T | T | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Y | S | S | T | I | L | R | F | S | G | I | Y | G | P | G | R | L | R | M | I | R | Q | A | Q | T | P | E | Q | W | P | A | R | N | A | W | T | N | R | I | H | R | D | D | G | A | A | F | I | A | Y | L | I | Q | Q | R | S | H | A | V | P | E | R | L | Y | I | V | T | D | N | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | T | T | B | T | T | G | G | G | S | S | S | B | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . |
Sequence | P | L | P | V | H | D | L | L | R | W | L | A | D | R | Q | G | I | A | Y | P | A | G | A | T | P | P | V | Q | G | N | K | K | L | S | N | A | R | L | L | A | S | G | Y | Q | L | I | Y | P | D | Y | V | S | G | Y | G | A | L | L | A | A | M | R | E | |||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | B | S | S | T | T | S | S | S | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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