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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3go6B_ | PDB header: transferase | Chain: B: PDB Molecule: ribokinase rbsk; | PDBTitle: crystal structure of m. tuberculosis ribokinase (rv2436) in2 complex with ribose and amp-pnp |
Added to library: Sun Aug 29 08:17:05 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | P | R | V | C | V | V | G | S | V | N | M | D | L | T | F | V | V | D | A | L | P | R | P | G | E | T | V | L | A | A | S | L | T | R | T | P | G | G | K | G | A | N | Q | A | V | A | A | A | R | A | G | A | Q | V | Q | F | S | G | A | F | G | D | D | P | A | A | A | Q | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | A | H | L | R | A | N | A | V | G | L | D | R | T | V | T | V | P | G | P | S | G | T | A | I | I | V | V | D | A | S | A | E | N | T | V | L | V | A | P | G | A | N | A | H | L | T | P | V | P | S | A | V | A | N | C | D | V | L | L | T | Q | L | E | I | P | V | A | T | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | T | T | S | S | T | T | G | G | G | G | G | G | G | G | G | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | A | A | A | R | A | A | Q | S | A | D | A | V | V | M | V | N | A | S | P | A | G | Q | D | R | S | S | L | Q | D | L | A | A | I | A | D | V | V | I | A | N | E | H | E | A | N | D | W | P | S | P | P | T | H | F | V | I | T | L | G | V | R | G | A | R | Y | V | G | A | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | G | G | G | S | T | S | S | S | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | G | V | F | E | V | P | A | P | T | V | T | P | V | D | T | A | G | A | G | D | V | F | A | G | V | L | A | A | N | W | P | R | N | P | G | S | P | A | E | R | L | R | A | L | R | R | A | C | A | A | G | A | L | A | T | L | V | S | G | V | G | D | C | A | P | A | A | A | A | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | D | A | A | L | R | A | N | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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