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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3gn6B_ | PDB header: structural genomics, unknown function | Chain: B: PDB Molecule: ct0912, orfan protein with a ferrodoxin-like | PDBTitle: crystal structure of ct0912, orfan protein from chlorobium2 tepidum with a ferrodoxin-like domain repeat (np_661805.1)3 from chlorobium tepidum tls at 1.80 a resolution |
Added to library: Sun Aug 29 06:08:46 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | F | N | P | W | T | D | A | A | L | D | T | I | R | D | V | N | Q | A | L | T | L | Y | A | E | X | R | V | V | P | A | H | H | D | A | F | L | A | A | I | D | T | V | S | A | K | L | R | V | L | P | G | F | L | S | L | A | L | K | Q | X | S | G | D | S | T | X | V | K | N | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | S | S | S | G | G | G | T | T | S | T | T | S | G | G | G | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | P | E | T | Y | K | G | V | L | A | T | A | Y | L | D | G | V | A | A | G | T | Q | P | Y | F | Y | N | L | F | V | R | F | A | D | G | R | A | A | R | A | A | G | F | E | A | L | F | E | T | H | I | H | P | L | L | H | A | X | A | D | G | P | E | L | L | A | Y | R | A | V | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T | G | G | G | B | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Q | S | V | V | A | G | D | R | H | A | I | Y | R | G | A | E | E | I | R | S | F | L | R | R | P | V | E | L | P | E | R | E | T | V | T | V | E | N | H | V | X | V | P | E | D | K | H | A | A | W | E | P | Q | V | A | I | L | L | Q | V | A | Q | D | T | F | E | P | Q | D | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | G | G | G | G | G | G | B | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | P | S | G | V | G | L | P | G | A | R | D | N | R | Y | Y | R | K | A | L | S | T | E | I | L | R | N | A | H | A | D | G | G | L | R | A | Y | I | X | H | G | V | W | E | S | V | W | D | H | E | N | S | H | L | D | P | R | F | L | A | A | A | G | P | V | G | A | A | A | V | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | B | S | S | S | B | T | T | S | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | G | P | V | E | P | F | Y | L | T | R | R | L | V | V | A | D | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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