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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3g9gA_ | PDB header: endocytosis | Chain: A: PDB Molecule: suppressor of yeast profilin deletion; | PDBTitle: crystal structure of the n-terminal efc/f-bar domain of syp1 |
Added to library: Sat Aug 28 18:05:51 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | T | E | Q | R | T | K | Y | A | D | S | I | L | T | T | K | S | P | Y | E | A | T | E | T | I | R | I | R | L | S | Q | V | K | L | L | N | K | D | F | Y | L | L | F | K | E | L | A | N | L | K | R | N | Y | A | Q | Q | L | R | K | I | I | A | E | N | E | D | I | T | K | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | N | A | Q | M | I | E | S | N | V | L | T | P | Q | E | M | S | A | F | R | F | N | S | L | G | E | L | R | N | V | W | D | T | V | I | E | E | L | K | S | D | L | K | S | S | T | E | Y | Y | N | T | L | D | Q | Q | V | V | R | E | L | K | E | S | V | E | N | N | T | S | W |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | R | E | S | K | D | L | H | S | K | L | S | K | N | A | A | S | I | E | H | Y | S | K | N | N | E | N | S | S | H | L | E | E | A | R | R | Q | W | D | Q | Q | S | P | Y | L | F | E | L | F | E | T | I | D | Y | N | R | L | D | T | L | K | N | C | M | L | R | F | Q | T | S | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | |||||||||||||||||||||||||
Sequence | S | D | Y | L | L | N | T | T | K | E | C | E | T | V | M | T | K | F | L | A | F | E | P | Q | S | E | I | D | R | F | A | K | D | A | S | Q | Y | N | F | Q | ||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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