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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3fynA_ | PDB header: structural genomics, unknown function | Chain: A: PDB Molecule: integron gene cassette protein hfx_cass3; | PDBTitle: crystal structure from the mobile metagenome of cole2 harbour salt marsh: integron cassette protein hfx_cass3 |
Added to library: Tue Mar 16 13:32:25 2010 | |
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Sequence | N | L | Y | F | Q | G | L | S | P | Q | V | R | T | A | H | I | G | D | V | P | V | L | V | R | L | X | S | E | F | Y | Q | E | A | G | F | A | L | P | H | D | A | A | I | R | A | F | K | A | L | L | G | K | P | D | L | G | R | I | W | L | I | A | E | G | T | E | S | V | G | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | S | G | G | G | G | G | G | T | T | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | V | L | T | L | G | F | S | X | E | Y | G | G | L | R | G | F | V | D | D | F | F | V | R | P | N | A | R | G | K | G | L | G | A | A | A | L | Q | T | V | K | Q | G | C | C | D | L | G | V | R | A | L | L | V | E | T | G | V | Y | S | R | A | G | F | E | E | S | G | R | X |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | G | G | G | T | T | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | L | L | G | Q | A | L | A | P | P | I | H | E | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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