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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3frmF_ | PDB header: structural genomics, unknown function | Chain: F: PDB Molecule: uncharacterized conserved protein; | PDBTitle: the crystal structure of a functionally unknown conserved2 protein from staphylococcus epidermidis atcc 12228. |
Added to library: Tue Mar 16 14:21:04 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | X | S | K | I | T | F | K | D | I | Y | I | D | G | N | K | I | T | E | D | S | R | K | A | I | Y | L | L | P | P | Q | P | L | K | Y | A | S | N | T | W | I | Y | K | T | X | P | T | X | N | Q | W | L | K | D | I | E | V | Q | K | K | X | H | L | N | Q | S | S | Y | H | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | S | S | S | S | T | T | S | T | T | G | G | G | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | F | S | F | P | A | N | E | K | I | D | E | V | L | L | E | K | I | R | E | L | G | F | Q | I | G | V | L | E | L | Y | V | I | E | A | K | A | L | K | E | L | S | R | K | R | D | V | D | I | Q | L | V | S | S | N | N | I | N | D | Y | L | H | V | Y | D | A | F | A | R | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | T | T | T | T | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | F | G | D | S | Y | A | N | X | V | K | Q | H | I | Y | S | S | Y | N | L | D | D | I | E | R | L | V | A | Y | V | N | H | Q | P | V | G | I | V | D | I | I | X | T | D | K | T | I | E | I | D | G | F | G | V | L | E | E | F | Q | H | Q | G | I | G | S | E | I | Q | A | Y | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | T | T | S | S | G | G | G | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | ||||||||||
Sequence | G | R | X | A | N | E | R | P | V | I | L | V | A | D | G | K | D | T | A | K | D | X | Y | L | R | Q | G | Y | V | Y | Q | G | F | K | Y | H | I | L | K | E | N | I | ||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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