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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3fmpD_ | PDB header: oncoprotein/hydrolase | Chain: D: PDB Molecule: atp-dependent rna helicase ddx19b; | PDBTitle: crystal structure of the nucleoporin nup214 in complex with2 the dead-box helicase ddx19 |
Added to library: Sat Aug 28 17:30:28 2010 | |
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Sequence | L | V | D | N | T | N | Q | V | E | V | L | Q | R | D | P | N | S | P | L | Y | S | V | K | S | F | E | E | L | R | L | K | P | Q | L | L | Q | G | V | Y | A | M | G | F | N | R | P | S | K | I | Q | E | N | A | L | P | L | M | L | A | E | P | P | Q | N | L | I | A | Q | S | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T | S | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | G | T | G | K | T | A | A | F | V | L | A | M | L | S | Q | V | E | P | A | N | K | Y | P | Q | C | L | C | L | S | P | T | Y | E | L | A | L | Q | T | G | K | V | I | E | Q | M | G | K | F | Y | P | E | L | K | L | A | Y | A | V | R | G | N | K | L | E | R | G | Q | K | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T | S | T | T | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | E | Q | I | V | I | G | T | P | G | T | V | L | D | W | C | S | K | L | K | F | I | D | P | K | K | I | K | V | F | V | L | D | E | A | D | V | M | I | A | T | Q | G | H | Q | D | Q | S | I | R | I | Q | R | M | L | P | R | N | C | Q | M | L | L | F | S | A | T | F | E | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | G | G | G | T | S | T | T | T | T | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | S | V | W | K | F | A | Q | K | V | V | P | D | P | N | V | I | K | L | K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S |
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