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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3fd9C_ | PDB header: unknown function | Chain: C: PDB Molecule: uncharacterized protein; | PDBTitle: crystal structure of the transcriptional anti-activator exsd2 from pseudomonas aeruginosa |
Added to library: Sun Aug 29 13:44:28 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | S | S | S | L | Y | R | E | S | G | I | I | S | A | R | Q | L | A | L | L | Q | R | X | L | P | R | L | R | L | E | Q | L | F | R | C | E | W | L | Q | Q | R | L | A | R | G | L | A | L | G | R | E | E | V | R | Q | I | L | L | C | A | A | Q | D | D | D | G | W | C | A | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | T | T | S | T | T | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | G | D | R | V | N | L | A | V | P | Q | S | X | I | D | W | V | L | L | P | V | Y | G | W | W | E | S | L | L | D | Q | A | I | P | G | W | R | L | S | L | V | E | L | E | T | Q | S | R | Q | L | R | I | K | S | E | F | W | S | R | V | A | E | L | E | P | E | Q | A | R | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | E | L | A | R | V | A | K | C | Q | A | R | T | Q | E | Q | V | A | E | L | A | G | K | L | E | T | A | S | A | L | A | K | S | A | W | P | N | W | Q | R | G | X | A | T | L | L | A | S | G | G | L | A | G | F | E | P | I | P | E | V | L | E | C | L | W | Q | P | L | C | R | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | S | S | G | G | G | S | G | G | G | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||
Sequence | D | D | D | V | G | A | A | D | A | V | Q | A | W | L | H | E | R | N | L | C | Q | A | Q | D | H | F | Y | W | Q | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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