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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3fb2B_ | PDB header: structural protein | Chain: B: PDB Molecule: spectrin alpha chain, brain spectrin; | PDBTitle: crystal structure of the human brain alpha spectrin repeats2 15 and 16. northeast structural genomics consortium target3 hr5563a. |
Added to library: Tue Mar 16 13:04:00 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | H | S | H | D | S | H | D | L | Q | R | F | L | S | D | F | R | D | L | X | S | W | I | N | G | I | R | G | L | V | S | S | D | E | L | A | K | D | V | T | G | A | E | A | L | L | E | R | H | Q | E | H | R | T | E | I | D | A | R | A | G | T | F | Q | A | F | E | Q | F | G | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Q | L | L | A | H | G | H | Y | A | S | P | E | I | K | Q | K | L | D | I | L | D | Q | E | R | A | D | L | E | K | A | W | V | Q | R | R | X | X | L | D | Q | C | L | E | L | Q | L | F | H | R | D | C | E | Q | A | E | N | W | X | A | A | R | E | A | F | L | D | S | V | E | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | |
Sequence | L | I | K | K | H | E | D | F | D | K | A | I | N | V | Q | E | E | K | I | A | A | L | Q | A | F | A | D | Q | L | I | A | A | G | H | Y | A | K | G | D | I | S | S | R | R | N | E | V | L | D | R | W | R | R | L | K | A | Q | X | I | E | K | R | ||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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