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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3f5sA_ | PDB header: oxidoreductase | Chain: A: PDB Molecule: dehydrogenase; | PDBTitle: crystal structure of putatitve short chain dehydrogenase2 from shigella flexneri 2a str. 301 |
Added to library: Tue Mar 16 13:58:20 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | Q | D | L | L | N | D | R | I | I | L | V | T | G | A | S | D | G | I | G | R | E | A | A | M | T | Y | A | R | Y | G | A | T | V | I | L | L | G | R | N | E | E | K | L | R | Q | V | A | S | H | I | N | E | E | T | G | R | Q | P | Q | W | F | I | L | D | L | L | T | C | T | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | N | C | Q | Q | L | A | Q | R | I | V | V | N | Y | P | R | L | D | G | V | L | H | N | A | G | L | L | G | D | V | C | P | M | S | E | Q | N | P | Q | V | W | Q | D | V | M | Q | I | N | V | N | A | T | F | M | L | T | Q | A | L | L | P | L | L | L | K | S | D | A | G | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | V | F | T | S | S | S | V | G | R | Q | G | R | A | N | W | G | A | Y | A | A | S | K | F | A | T | E | G | M | M | Q | V | L | A | D | E | Y | Q | Q | R | L | R | V | N | C | I | N | P | G | G | T | R | T | P | Q | K | L | K | T | P | A | D | I | M | P | L | Y | L | W | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | S | T | T | T | T | T | T | S | B | T | T | S | B | G | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | M | G | D | D | S | R | R | K | T | G | M | T | F | D | A | Q | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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