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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3eplA_ | PDB header: transferase/rna | Chain: A: PDB Molecule: trna isopentenyltransferase; | PDBTitle: crystallographic snapshots of eukaryotic2 dimethylallyltransferase acting on trna: insight into trna3 recognition and reaction mechanism |
Added to library: Tue Mar 16 13:03:12 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | K | K | V | I | V | I | A | G | T | T | G | V | G | K | S | Q | L | S | I | Q | L | A | Q | K | F | N | G | E | V | I | N | S | D | S | M | Q | V | Y | K | D | I | P | I | I | T | N | K | H | P | L | Q | E | R | E | G | I | P | H | H | V | M | N | H | V | D | W | S | E | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | B | T | T | T | S | S | S | S | G | G | G | G | T | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Y | Y | S | H | R | F | E | T | E | C | M | N | A | I | E | D | I | H | R | R | G | K | I | P | I | V | V | G | G | T | H | Y | Y | L | Q | T | L | F | N | K | R | V | D | T | K | S | S | E | R | K | L | T | R | K | Q | L | D | I | L | E | S | T | D | P | D | V | I | Y | N | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | B | S | T | T | G | G | G | G | G | B | S | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | V | K | C | D | P | D | I | A | T | K | Y | H | P | N | D | Y | R | R | V | Q | R | M | L | E | I | Y | Y | K | T | G | K | K | P | S | E | T | F | N | E | Q | K | I | T | L | K | F | D | T | L | F | L | W | L | Y | S | K | P | E | P | L | F | Q | R | L | D | D | R | V | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | S | T | T | S | S | T | B | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | D | M | L | E | R | G | A | L | Q | E | I | K | Q | L | Y | E | Y | Y | S | Q | N | K | F | T | P | E | Q | C | E | N | G | V | W | Q | V | I | G | F | K | E | F | L | P | W | L | T | V | K | L | E | D | C | I | E | R | M | K | T | R | T | R | Q | Y | A | K | R | Q | V | K | W |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | T | T | S | S | S | S | S | G | G | G | S | T | T | T | G | G | G | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 350 |
Sequence | I | K | K | M | L | I | P | D | I | K | G | D | I | Y | L | L | D | A | T | D | L | S | Q | W | D | T | N | A | S | Q | R | A | I | A | I | S | N | D | F | I | S | N | R | P | I | K | Q | E | R | A | P | K | A | L | E | E | L | L | S | K | G | E | T | T | M | K | K | L | D | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | T | T | S | T | T | T | S | S | S | S | T | T | G | G | G | S | G | G | G | T | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 360 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 370 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 380 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 390 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 400 | . | . |
Sequence | W | T | H | Y | T | C | N | V | C | R | N | A | D | G | K | N | V | V | A | I | G | E | K | Y | W | K | I | H | L | G | S | R | R | H | K | S | N | L | K | R | N | T | R | Q | A | D | F | E | K | W | K | I | ||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S | T | T | T | S |
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