|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c3ejjX_ | PDB header: cytokine/signaling protein | Chain: X: PDB Molecule: macrophage colony-stimulating factor 1 receptor; | PDBTitle: structure of m-csf bound to the first three domains of fms |
Added to library: Tue Mar 16 13:59:28 2010 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | A | P | V | I | E | P | S | G | P | E | L | V | V | E | P | G | E | T | V | T | L | R | C | V | S | N | G | S | V | E | W | D | G | P | I | S | P | Y | W | T | L | D | P | E | S | P | G | S | T | L | T | T | R | N | A | T | F | K | N | T | G | T | Y | R | C | T | E | L | E | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | T | I | H | L | Y | V | K | D | P | A | H | S | W | N | L | L | A | Q | E | V | T | V | V | E | G | Q | E | A | V | L | P | C | L | I | T | D | P | A | L | K | D | S | V | S | L | M | R | E | G | G | R | Q | V | L | R | K | T | V | Y | F | F | S | P | W | R | G | F | I | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | T | S | S | G | G | G | G | G | S | G | G | G | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | R | K | A | K | V | L | D | S | N | T | Y | V | C | K | T | M | V | N | G | R | E | S | T | S | T | G | I | W | L | K | V | N | R | V | H | P | E | P | P | Q | I | K | L | E | P | S | K | L | V | R | I | R | G | E | A | A | Q | I | V | C | S | A | T | N | A | E | V | G | F | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . |
Sequence | V | I | L | K | R | G | D | T | K | L | E | I | P | L | N | S | D | F | Q | D | N | Y | Y | K | K | V | R | A | L | S | L | N | A | V | D | F | Q | D | A | G | I | Y | S | C | V | A | S | N | D | V | G | T | R | T | A | T | M | N | F | Q | V | V | ||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|