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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3egbA_ | PDB header: protein binding | Chain: A: PDB Molecule: protein pellino homolog 2; | PDBTitle: structure of pellino2 fha domain at 3.3 angstroms2 resolution. |
Added to library: Tue Mar 16 13:27:17 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | P | V | K | Y | G | E | L | V | V | L | G | Y | R | K | S | R | F | A | L | Y | K | R | P | K | A | N | G | V | K | P | S | T | V | H | V | I | S | T | P | Q | I | S | C | K | G | Q | H | S | I | S | Y | T | L | S | R | N | Q | T | V | V | V | E | Y | T | H | D | K | D | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | M | F | Q | V | G | R | S | T | E | S | P | I | D | F | V | V | T | D | T | I | T | Q | S | T | I | S | R | F | A | C | R | I | V | C | D | R | N | E | P | Y | T | A | R | I | F | A | A | G | F | D | S | S | K | N | I | F | L | G | E | K | A | A | K | W | K | N | P | D | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | T | T | S | S | T | T | B | T | T | S | - | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | H | M | D | G | L | T | T | N | G | V | L | V | M | H | P | R | G | S | Q | P | G | V | W | R | E | I | S | V | C | G | D | V | Y | T | L | R | E | T | R | S | A | Q | Q | R | G | K | L | V | E | S | E | T | N | V | L | Q | D | G | S | L | I | D | L | C | G | A | T | L | L | W |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | B | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||
Sequence | R | T | A | D | G | L | F | H | T | P | T | Q | K | H | I | E | A | L | R | Q | E | I | N | A | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | G | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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