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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3ee1A_ | PDB header: hydrolase | Chain: A: PDB Molecule: effector protein vira; | PDBTitle: novel fold of vira, a type iii secretion system effector2 protein from shigella flexneri |
Added to library: Tue Mar 16 12:07:32 2010 | |
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Sequence | E | V | A | S | Y | C | D | R | V | V | A | A | V | E | K | K | L | X | D | S | F | S | P | S | L | S | Q | D | K | X | D | G | E | F | A | H | A | N | I | D | G | I | S | I | R | L | C | L | N | K | G | I | C | S | V | F | Y | L | D | G | D | K | I | Q | S | T | Q | L | S | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | G | G | G | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | E | Y | N | N | L | L | S | S | L | P | P | K | Q | F | N | L | G | K | V | H | T | I | T | A | P | V | S | G | N | F | K | T | H | K | P | A | P | E | V | I | E | T | A | I | N | C | C | T | S | I | I | P | N | D | D | Y | F | P | V | K | D | T | D | F | N | S | V | W | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | B | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | D | I | Y | R | D | I | R | A | S | D | S | N | S | T | K | I | Y | F | N | N | I | E | I | P | L | K | L | I | A | D | L | I | N | E | L | G | I | N | E | F | I | D | S | K | K | E | L | Q | X | L | S | Y | N | Q | L | N | K | I | I | N | S | N | F | P | Q | Q | D | L | C | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | Q | T | E | K | L | L | F | T | S | L | F | Q | D | P | A | F | I | S | A | L | T | S | A | F | W | Q | S | L | H | I | T | S | S | S | V | E | H | I | Y | A | Q | I | X | S | E | N | I | E | N | R | L | N | F | X | P | E | N | N | C | G | H | I | I | K | I | N | A | V | V | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . |
Sequence | G | R | A | Y | E | V | S | S | S | I | L | P | S | H | I | T | C | N | G | V | G | I | N | K | I | E | T | S | Y | L | V | H | A | G | T | L | P | S | S | E | G | L | R | N | A | I | P | P | E | S | R | Q | V | S | F | A | I | I | S | P | D | |||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | G | G | G |
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