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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3e02A_ | PDB header: metal binding protein | Chain: A: PDB Molecule: uncharacterized protein duf849; | PDBTitle: crystal structure of a protein of unknown function from duf849 family2 (bxe_c0271) from burkholderia xenovorans lb400 at 1.90 a resolution |
Added to library: Tue Mar 16 12:41:30 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | X | K | Q | S | K | K | I | I | I | T | C | A | V | T | G | S | I | H | T | P | T | X | S | P | Y | L | P | I | T | P | E | E | I | V | K | E | G | V | A | A | A | E | A | G | A | A | X | L | H | L | H | A | R | D | P | L | N | G | R | P | S | Q | D | P | D | L | F | X | R | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | S | S | S | S | G | G | G | T | T | S | S | T | S | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | P | Q | L | K | E | R | T | D | A | I | L | N | I | T | T | G | G | G | L | G | X | S | L | D | E | R | L | A | P | A | R | A | A | R | P | E | V | A | S | X | N | X | G | S | L | N | F | N | I | S | Q | A | A | A | K | F | D | T | F | K | F | D | W | E | R | P | Y | L | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | S | B | G | G | G | G | G | G | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | G | T | R | D | F | I | L | S | N | T | F | S | Q | I | E | R | G | X | T | E | L | G | A | S | G | T | R | F | E | F | E | C | Y | D | V | G | H | L | Y | N | L | A | H | F | V | D | R | K | L | V | E | P | P | F | F | L | Q | C | V | F | G | I | L | G | G | I | G | A | D | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | T | S | T | T | S | S | S | B | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | E | N | L | L | H | X | R | T | I | A | D | R | L | F | G | Q | D | Y | Y | L | S | V | L | A | A | G | R | H | Q | X | P | F | V | T | X | S | A | I | L | G | G | N | V | R | V | G | L | E | D | S | L | Y | S | G | K | G | Q | L | A | T | S | N | A | E | Q | V | R | K | I | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | G | G | G | T | T | S | T | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | |||||||||||||||||||||||
Sequence | R | I | I | E | E | L | S | L | D | I | A | T | P | D | E | A | R | A | X | L | K | T | K | G | A | N | E | T | S | F | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | T | G | G | G | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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