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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3dzxA_ | PDB header: hydrolase activator | Chain: A: PDB Molecule: tbc1 domain family member 22b; | PDBTitle: crystal structure of the rabgap domain of human tbc1d22b |
Added to library: Wed Jan 9 15:18:35 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | R | L | E | K | F | R | Q | L | L | S | S | Q | N | T | D | L | D | E | L | R | K | C | S | W | P | G | V | P | R | E | V | R | P | I | T | W | R | L | L | S | G | Y | L | P | A | N | T | L | Q | R | K | R | E | E | Y | F | G | F | I | E | Q | Y | Y | P | L | F | Q | Q | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | T | T | G | G | G | T | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | V | Q | E | I | F | E | R | I | L | F | I | W | A | I | R | H | P | A | S | G | I | N | D | L | V | T | P | F | F | V | V | F | L | S | E | Y | V | E | E | D | V | E | N | F | D | V | T | N | L | S | Q | D | M | L | R | S | I | E | A | D | S | F | W | C | M | S | K | L | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | G | G | G | S | G | G | G | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | D | G | I | Q | D | N | Y | T | F | A | Q | P | G | I | Q | K | K | V | K | A | L | E | E | L | V | S | R | I | D | E | Q | V | H | N | H | F | R | R | Y | E | V | E | Y | L | Q | F | A | F | R | W | M | N | N | L | L | M | R | E | L | P | L | R | C | T | I | R | L | W | D | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | Y | Q | S | E | P | S | H | F | H | L | Y | V | C | A | A | F | L | I | K | W | R | K | E | I | L | D | E | E | D | F | Q | G | L | L | M | L | L | Q | N | L | P | T | I | H | W | G | N | E | E | I | G | L | L | L | A | E | A | Y | R | L | K | Y | M | F | A | D | A | P | ||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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