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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3dtpF_ | PDB header: contractile protein | Chain: F: PDB Molecule: myosin regulatory light chain; | PDBTitle: tarantula heavy meromyosin obtained by flexible docking to2 tarantula muscle thick filament cryo-em 3d-map |
Added to library: Tue Mar 16 12:54:06 2010 | |
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Sequence | M | G | D | D | E | K | K | E | K | K | K | K | S | K | K | K | A | E | E | E | G | G | D | A | P | A | A | P | P | A | P | K | P | P | S | Q | K | R | R | A | Q | R | S | G | S | N | V | F | A | M | F | T | Q | H | Q | V | Q | E | F | K | E | A | F | Q | L | I | D | Q | D | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | G | G | G | S | S | S | S | S | S | S | S | G | G | G | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | G | F | I | S | K | N | D | I | R | A | T | F | D | S | L | G | R | L | C | T | E | Q | E | L | D | S | M | V | A | E | A | P | G | P | I | N | F | T | M | F | L | T | I | F | G | D | R | I | A | G | T | D | E | E | D | V | I | V | N | A | F | N | L | F | D | E | G | D | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | T | T | T | G | G | G | G | S | S | S | S | S | G | G | G | S | S | T | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . |
Sequence | K | C | K | E | E | T | L | K | R | S | L | T | T | W | G | E | K | F | S | Q | D | E | V | D | Q | A | L | S | E | A | P | I | D | G | N | G | L | I | D | I | K | K | F | A | Q | I | L | T | K | G | A | K | E | E | G | A | ||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | S | B | S | S | T | T | T | S | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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