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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3dpqE_ | PDB header: chaperone, peptide binding protein | Chain: E: PDB Molecule: chaperone protein dnak; | PDBTitle: crystal structure of the substrate binding domain of e.2 coli dnak in complex with a long pyrrhocoricin-derived3 inhibitor peptide (form b) |
Added to library: Tue Mar 16 12:54:57 2010 | |
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Sequence | V | L | L | L | D | V | T | P | L | S | L | G | I | E | T | M | G | G | V | M | T | T | L | I | A | K | N | T | T | I | P | T | K | H | S | Q | V | F | S | T | A | E | D | N | Q | S | A | V | T | I | H | V | L | Q | G | E | R | K | R | A | A | D | N | K | S | L | G | Q | F | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | T | T | T | T | T | B | S | S | S | S | T | T | S | S | S | B | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | D | G | I | N | P | A | P | R | G | M | P | Q | I | E | V | T | F | D | I | D | A | D | G | I | L | H | V | S | A | K | D | K | N | S | G | K | E | Q | K | I | T | I | K | A | S | S | G | L | N | E | D | E | I | Q | K | M | V | R | D | A | E | A | N | A | E | A | D | R | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . |
Sequence | F | E | E | L | V | Q | T | R | N | Q | G | D | H | L | L | H | S | T | R | K | Q | V | D | D | K | T | A | I | E | S | A | L | T | A | L | E | T | A | L | K | G | E | D | K | A | A | I | E | A | K | M | Q | E | L | A | Q | V | S | Q | K | L | M | E | |||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T | S | G | G | G | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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