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| Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 | |||||||
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| Fold library id | PDB Header | Molecule | Title | 
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| c3ddyA_ | PDB header: luminescent protein | Chain: A: PDB Molecule: lumazine protein; | PDBTitle: structure of lumazine protein, an optical transponder of2 luminescent bacteria | 
| Added to library: Tue Mar 16 14:02:32 2010 | |
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| Links to external resources | |
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| Sequence | M | F | R | G | I | V | Q | G | R | G | V | I | R | S | I | S | K | S | E | D | S | Q | R | H | G | I | A | F | P | E | G | M | F | Q | L | V | D | V | D | T | V | M | L | V | N | G | C | S | N | T | V | V | R | I | L | G | D | M | V | Y | F | D | I | D | Q | A | L | G | T | T | 
| Predicted secondary structure |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | |||||||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) | B | S |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | S | S |  |  |  |  |  |  | T | T | T | G | G | G | T | T |  |  |  |  | T | T |  |  |  |  |  |  |  |  |  | T | T |  |  |  |  |  |  | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 | 
| Sequence | T | F | D | G | L | K | E | G | D | Q | V | N | L | E | I | H | P | G | L | T | G | N | I | K | G | T | A | L | V | A | A | I | E | E | N | D | A | G | F | S | V | L | I | D | I | P | K | G | L | A | E | N | L | T | V | K | D | D | I | G | I | D | G | I | S | L | P | I | T | D | 
| Predicted secondary structure |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | ||||||||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | T | T |  |  |  |  |  | B | S |  |  |  |  |  |  |  |  |  | S | S |  |  |  |  |  |  |  | T | T | T | S | T | T |  |  |  |  | T | T |  |  |  |  |  |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | 
| Sequence | M | S | D | S | I | I | T | L | N | Y | S | R | D | L | L | A | S | T | N | I | A | S | L | A | K | D | V | K | V | N | V | E | I | L | N | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Predicted secondary structure |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) |  |  | T | T |  |  |  |  |  |  |  | G | G | G | G | G | T | S | S | G | G | G | T | T |  |  |  |  |  |  | 
| Download: | PDB structure | FASTA sequence | 
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