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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3dddA_ | PDB header: transferase | Chain: A: PDB Molecule: putative acetyltransferase; | PDBTitle: crystal structure of a putative acetyltransferase2 (np_142035.1) from pyrococcus horikoshii at 2.25 a3 resolution |
Added to library: Tue Mar 16 13:24:36 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | H | H | H | H | H | E | N | L | Y | F | Q | G | X | I | I | R | Y | A | T | P | D | D | I | E | D | X | V | S | I | F | I | D | A | Y | N | F | P | G | P | R | E | S | V | K | S | S | F | E | I | S | L | E | V | Q | P | D | G | C | L | L | A | F | L | K | D | E | P | V | G | X |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | G | G | G | T | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | C | I | F | F | Y | N | K | Q | A | W | I | G | L | X | G | V | K | K | A | Y | Q | R | R | G | I | G | T | E | V | F | R | R | L | L | E | I | G | R | R | K | V | D | T | I | R | L | D | A | S | S | Q | G | Y | G | L | Y | K | K | F | K | F | V | D | E | Y | R | T | V | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | S | S | S | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Y | E | L | X | E | R | P | I | K | R | V | E | G | V | V | E | V | N | K | I | P | N | W | V | K | E | I | D | K | K | A | F | G | D | D | R | I | R | V | L | E | A | Y | X | R | R | G | A | R | L | L | C | A | E | N | E | G | F | G | L | V | Y | R | G | K | I | G | P | L | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | A | D | S | P | R | V | A | E | K | I | L | L | K | A | F | Q | L | G | A | R | E | I | I | I | P | E | V | N | K | D | A | L | E | L | I | K | I | F | K | P | S | Q | V | T | S | C | X | R | X | R | L | G | S | K | I | E | E | K | V | D | I | Y | Y | G | I | L | A | Y | A | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | G | G | G | S | G | G | G | S | T | T | T |   | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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