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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3d0cB_ | PDB header: lyase | Chain: B: PDB Molecule: dihydrodipicolinate synthase; | PDBTitle: crystal structure of dihydrodipicolinate synthase from2 oceanobacillus iheyensis at 1.9 a resolution |
Added to library: Tue Mar 16 12:05:16 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | D | Y | G | E | F | S | K | R | F | S | T | I | S | G | I | N | I | V | P | F | L | E | G | T | R | E | I | D | W | K | G | L | D | D | N | V | E | F | L | L | Q | N | G | I | E | V | I | V | P | N | G | N | T | G | E | F | Y | A | L | T | I | E | E | A | K | Q | V | A | T | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | S | S | B | T | T | T | B | T | T | T | T | S | G | G | G | T | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | T | E | L | V | N | G | R | A | T | V | V | A | G | I | G | Y | S | V | D | T | A | I | E | L | G | K | S | A | I | D | S | G | A | D | C | V | X | I | H | Q | P | V | H | P | Y | I | T | D | A | G | A | V | E | Y | Y | R | N | I | I | E | A | L | D | A | P | S | I | I | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | F | K | D | A | H | L | S | D | D | V | I | K | E | L | A | P | L | D | K | L | V | G | I | K | Y | A | I | N | D | I | Q | R | V | T | Q | V | X | R | A | V | P | K | S | S | N | V | A | F | I | C | G | T | A | E | K | W | A | P | F | F | Y | H | A | G | A | V | G | F | T | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | T | T | S | G | G | G | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | G | L | V | N | V | F | P | Q | K | S | F | A | L | L | E | A | L | E | E | G | N | Q | E | K | I | W | D | V | W | E | D | V | V | P | F | E | D | L | R | A | K | H | N | N | G | N | N | V | V | I | I | K | E | A | X | E | Q | L | G | L | R | A | G | V | T | R | E | P | V | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | T | T | T | T | T | T | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | P | L | S | P | N | D | R | L | E | L | E | E | L | L | K | S | W | N | T | Q | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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