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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3cuqA_ | PDB header: protein transport | Chain: A: PDB Molecule: vacuolar-sorting protein snf8; | PDBTitle: integrated structural and functional model of the human2 escrt-ii complex |
Added to library: Tue Mar 16 12:54:39 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | Q | M | S | K | Q | L | D | M | F | K | T | N | L | E | E | F | A | S | K | H | K | Q | E | I | R | K | N | P | E | F | R | V | Q | F | Q | D | M | C | A | T | I | G | V | D | P | L | A | S | G | K | G | F | W | S | E | M | L | G | V | G | D | F | Y | Y | E | L | G | V | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | I | E | V | C | L | A | L | K | H | R | N | G | G | L | I | T | L | E | E | L | H | Q | Q | V | L | K | G | R | G | K | F | A | Q | D | V | S | Q | D | D | L | I | R | A | I | K | K | L | K | A | L | G | T | G | F | G | I | I | P | V | G | G | T | Y | L | I | Q | S | V | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | S | S | G | G | G | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | E | L | N | M | D | H | T | V | V | L | Q | L | A | E | K | N | G | Y | V | T | V | S | E | I | K | A | S | L | K | W | E | T | E | R | A | R | Q | V | L | E | H | L | L | K | E | G | L | A | W | L | D | L | Q | A | P | G | E | A | H | Y | W | L | P | A | L | F | T | D | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | Y | S | Q | E | I | T | A | E | E | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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