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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3csqC_ | PDB header: hydrolase | Chain: C: PDB Molecule: morphogenesis protein 1; | PDBTitle: crystal and cryoem structural studies of a cell wall2 degrading enzyme in the bacteriophage phi29 tail |
Added to library: Tue Mar 16 13:37:03 2010 | |
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Sequence | M | V | Y | V | S | N | K | Y | L | T | M | S | E | M | K | V | N | A | Q | Y | I | L | N | Y | L | S | S | N | G | W | T | K | Q | A | I | C | G | M | L | G | N | M | Q | S | E | S | T | I | N | P | G | L | W | Q | N | L | D | E | G | N | T | S | L | G | F | G | L | V | Q | W |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | B | G | G | G | T | T | T | T | S | B | T | T | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | P | A | S | N | Y | I | N | W | A | N | S | Q | G | L | P | Y | K | N | M | D | S | E | L | K | R | I | I | W | E | V | N | N | N | A | Q | W | I | N | L | R | D | M | T | F | K | E | Y | I | K | S | T | K | T | P | R | E | L | A | M | I | F | L | A | S | Y | E | R | P | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | S | S | T | T | S | S | S | S | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | N | P | N | Q | P | E | R | G | D | Q | A | E | Y | W | Y | K | N | L | S | L | Q | L | A | Q | F | P | M | D | I | I | N | I | S | Q | G | E | N | G | S | F | S | H | K | G | T | L | C | I | D | F | V | G | K | T | E | K | Y | P | Y | Y | A | P | C | D | C | T | C | V | W | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | B | B | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | G | D | A | S | A | Y | L | A | W | T | S | D | K | E | V | M | C | A | D | G | S | V | R | Y | I | T | W | V | N | V | H | E | S | P | L | P | F | D | V | G | K | K | L | K | K | G | D | L | M | G | H | T | G | I | G | G | D | H | W | H | F | N | V | I | D | G | K | E | Y | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | T | T | S | S | S | T | T | T | T | S | B | B | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | |||||
Sequence | G | W | T | K | K | P | D | S | C | L | A | G | T | E | L | H | I | Y | D | V | F | A | V | N | N | V | E | I | I | N | G | N | G | Y | D | W | K | T | S | D | W | Q | D | G | ||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | B | T | T | T | T |
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