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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3cl3A_ | PDB header: viral protein/signaling protein | Chain: A: PDB Molecule: orf k13; | PDBTitle: crystal structure of a vflip-ikkgamma complex: insights2 into viral activation of the ikk signalosome |
Added to library: Tue Mar 16 13:10:23 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | T | Y | E | V | L | C | E | V | A | R | K | L | G | T | D | D | R | E | V | V | L | F | L | L | N | V | F | I | P | Q | P | T | L | A | Q | L | I | G | A | L | R | A | L | K | E | E | G | R | L | T | F | P | L | L | A | E | C | L | F | R | A | G | R | R | D | L | L | R | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | S | T | T | T | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | L | H | L | D | P | R | F | L | E | R | H | L | A | G | T | M | S | Y | F | S | P | Y | Q | L | T | V | L | H | V | D | G | E | L | C | A | R | D | I | R | S | L | I | F | L | S | K | D | T | I | G | S | R | S | T | P | Q | T | F | L | H | W | V | Y | C | M | E | N | L | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | |||||||||||||||||||
Sequence | L | L | G | P | T | D | V | D | A | L | M | S | M | L | R | S | L | S | R | V | D | L | Q | R | Q | V | Q | T | L | M | G | L | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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