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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3cjdB_ | PDB header: transcription regulator | Chain: B: PDB Molecule: transcriptional regulator, tetr family; | PDBTitle: crystal structure of putative tetr transcriptional2 regulator (yp_510936.1) from jannaschia sp. ccs1 at 1.79 a3 resolution |
Added to library: Tue Mar 16 12:14:22 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | A | L | R | E | K | L | I | D | L | A | E | A | Q | I | E | A | E | G | L | A | S | L | R | A | R | E | L | A | R | Q | A | D | C | A | V | G | A | I | Y | T | H | F | Q | D | L | N | A | L | T | L | E | V | N | G | R | T | F | A | R | L | G | A | A | V | G | A | V | D | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | P | N | E | R | L | I | A | X | S | H | A | Y | L | A | F | A | R | E | H | P | K | L | W | R | A | L | F | D | V | E | X | R | S | D | G | P | V | P | Q | W | Y | G | H | A | X | A | Q | L | F | S | Y | I | T | T | P | L | A | K | I | F | P | E | S | D | D | A | E | L | D | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | |||||||||||||||||||
Sequence | X | T | R | T | L | F | S | S | V | H | G | I | V | L | L | G | L | E | N | R | I | S | G | V | P | G | E | Q | L | K | T | X | I | R | L | L | L | E | Q | V | G | R | ||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | G | G | G | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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