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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3bm3A_ | PDB header: hydrolase/dna | Chain: A: PDB Molecule: pspgi restriction endonuclease; | PDBTitle: restriction endonuclease pspgi-substrate dna complex |
Added to library: Tue Mar 16 14:28:10 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | V | R | N | L | V | I | D | I | T | K | K | P | T | Q | N | I | P | P | T | N | E | I | I | E | E | A | I | T | E | L | N | V | D | E | L | L | D | R | L | F | E | K | D | E | S | G | E | V | I | T | P | S | R | I | A | K | X | L | E | E | K | A | F | E | I | Y | K | E | Y | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | G | G | G | G | S | T | T | T | T | S | B | T | T | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | Q | V | R | E | A | Y | L | S | A | G | Y | S | R | E | K | L | E | Q | S | F | Q | Q | A | R | F | S | R | G | G | K | A | F | E | I | I | F | T | K | L | L | N | K | F | G | I | R | Y | E | H | D | R | V | I | K | I | Y | D | Y | I | T | E | G | E | K | P | A | F | I | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | B | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | P | S | V | R | T | F | L | N | D | P | S | S | A | I | L | I | T | V | K | R | K | V | R | E | R | W | R | E | A | V | G | E | A | Q | I | L | R | N | K | F | G | D | E | I | N | F | W | F | V | G | F | D | E | E | F | T | I | Y | S | A | I | A | X | L | D | N | G | I | D | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | |||
Sequence | V | Y | V | I | D | G | R | Y | D | S | L | I | E | E | I | K | R | I | S | D | P | N | F | N | E | D | K | Y | I | Q | K | I | R | R | F | S | D | I | F | D | D | I | I | Q | F | L | N | K | H | |||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | G | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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