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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3bgyA_ | PDB header: hydrolase, viral protein | Chain: A: PDB Molecule: polynucleotide 5'-triphosphatase; | PDBTitle: triclinic structure of mimivirus capping enzyme2 triphosphatase at 1.65 a |
Added to library: Tue Mar 16 12:26:54 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | I | T | I | F | S | E | N | E | Y | N | E | I | V | E | M | L | R | D | Y | S | N | G | D | N | L | E | F | E | V | S | F | K | N | I | N | Y | P | N | F | M | R | I | T | E | H | Y | I | N | I | T | P | E | N | K | I | E | S | N | N | Y | L | D | I | S | L | I | F | P | D | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | G | G | G | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | V | Y | R | V | S | L | F | N | Q | E | Q | I | G | E | F | I | T | K | F | S | K | A | S | S | N | D | I | S | R | Y | I | V | S | L | D | P | S | D | D | I | E | I | V | Y | K | N | R | G | S | G | K | L | I | G | I | D | N | W | A | I | T | I | K | S | T | E | E | I | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | B | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | V | A | G | K | S | K | I | S | K | P | K | I | T | G | S | E | R | I | M | Y | R | Y | K | T | R | Y | S | F | T | I | N | K | N | S | R | I | D | I | T | D | V | K | S | S | P | I | I | W | K | L | M | T | V | P | S | N | Y | E | L | E | L | E | L | I | N | K | I | D | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | S | S | S | T | T | G | G | G | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | N | T | L | E | S | E | L | L | N | V | F | M | I | I | Q | D | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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