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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3axtA_ | PDB header: transferase | Chain: A: PDB Molecule: probable n(2),n(2)-dimethylguanosine trna methyltransferase | PDBTitle: complex structure of trna methyltransferase trm1 from aquifex aeolicus2 with s-adenosyl-l-methionine |
Added to library: Sat Aug 6 09:53:29 2011 | |
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Sequence | M | E | I | V | Q | E | G | I | A | K | I | I | V | P | E | I | P | K | T | V | S | S | D | M | P | V | F | Y | N | P | R | M | R | V | N | R | D | L | A | V | L | G | L | E | Y | L | C | K | K | L | G | R | P | V | K | V | A | D | P | L | S | A | S | G | I | R | A | I | R | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S | S | G | G | G | S | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | L | E | T | S | C | V | E | K | A | Y | A | N | D | I | S | S | K | A | I | E | I | M | K | E | N | F | K | L | N | N | I | P | E | D | R | Y | E | I | H | G | M | E | A | N | F | F | L | R | K | E | W | G | F | G | F | D | Y | V | D | L | D | P | F | G | T | P | V | P | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | G | G | G | S | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | I | E | S | V | A | L | S | M | K | R | G | G | I | L | S | L | T | A | T | D | T | A | P | L | S | G | T | Y | P | K | T | C | M | R | R | Y | M | A | R | P | L | R | N | E | F | K | H | E | V | G | I | R | I | L | I | K | K | V | I | E | L | A | A | Q | Y | D | I | A | M | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | B | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | P | I | F | A | Y | S | H | L | H | Y | F | K | L | F | F | V | K | E | R | G | V | E | K | V | D | K | L | I | E | Q | F | G | Y | I | Q | Y | C | F | N | C | M | N | R | E | V | V | T | D | L | Y | K | F | K | E | K | C | P | H | C | G | S | K | F | H | I | G | G | P | L | W |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | G | G | G | S | B | T | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 350 |
Sequence | I | G | K | L | W | D | E | E | F | T | N | F | L | Y | E | E | A | Q | K | R | E | E | I | E | K | E | T | K | R | I | L | K | L | I | K | E | E | S | Q | L | Q | T | V | G | F | Y | V | L | S | K | L | A | E | K | V | K | L | P | A | Q | P | P | I | R | I | A | V | K | F | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | S | T | S | S | S | T | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 360 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 370 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 380 | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||
Sequence | N | G | V | R | T | H | F | V | G | D | G | F | R | T | N | L | S | F | E | E | V | M | K | K | M | E | E | L | K | E | K | Q | K | E | F | L | E | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | T | T | S | S | T | T |
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