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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3ax1A_ | PDB header: protein binding | Chain: A: PDB Molecule: serrate rna effector molecule; | PDBTitle: molecular insights into mirna processing by arabidopsis serrate |
Added to library: Sat Jul 16 09:32:25 2011 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | L | M | S | Y | K | Q | F | I | Q | E | L | E | D | D | I | L | P | S | E | A | E | R | R | Y | Q | E | Y | K | S | E | Y | I | T | T | Q | K | R | A | F | F | N | T | H | K | E | E | D | W | L | K | N | K | Y | H | P | T | N | L | L | S | V | I | E | R | R | N | D | L | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Q | K | V | A | K | D | F | L | L | D | L | Q | S | G | T | L | D | L | G | P | A | V | T | A | L | N | A | A | P | K | A | P | S | F | T | S | D | P | K | R | I | L | T | D | V | E | Q | T | Q | A | L | V | R | K | L | D | S | E | K | K | I | E | E | N | V | L | Q | S | T | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | B | S | S | B | G | G | G | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | P | V | V | I | I | R | G | L | T | S | V | K | G | L | E | G | V | E | L | L | D | T | L | V | T | Y | L | W | R | V | H | G | L | D | Y | Y | G | K | V | E | T | N | E | A | K | G | L | R | H | V | R | D | E | N | E | S | K | F | D | S | H | W | Q | E | R | L | K | G | Q | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | G | G | G | T | T | T | S | B | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | P | L | E | V | M | A | A | K | E | K | I | D | A | A | A | T | E | A | L | D | P | H | V | R | K | I | R | D | E | K | Y | G | W | K | Y | G | C | G | A | K | G | C | T | K | L | F | H | A | A | E | F | V | Y | K | H | L | K | L | K | H | T | E | L | V | T | E | L | T | T | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | V | R | E | E | L | Y | F | Q | N | Y | L | E | H | H | H | H | H | H | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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