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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3am2A_ | PDB header: toxin | Chain: A: PDB Molecule: heat-labile enterotoxin b chain; | PDBTitle: clostridium perfringens enterotoxin |
Added to library: Sat Apr 16 08:51:15 2011 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | N | L | S | D | G | L | Y | V | I | D | K | G | D | G | W | I | L | G | E | P | S | V | V | S | S | Q | I | L | N | P | N | E | T | G | T | F | S | Q | S | L | T | K | S | K | E | V | S | I | N | V | N | F | S | V | G | F | T | S | E | F | I | Q | A | S | V | E | Y | G | F | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | T | T | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | T | I | G | E | Q | N | T | I | E | R | S | V | S | T | T | A | G | P | N | E | Y | V | Y | Y | K | V | Y | A | T | Y | R | K | Y | Q | A | I | R | I | S | H | G | N | I | S | D | D | G | S | I | Y | K | L | T | G | I | W | L | S | K | T | S | A | D | S | L | G | N | I | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Q | G | S | L | I | E | T | G | E | R | C | V | L | T | V | P | S | T | D | I | E | K | E | I | L | D | L | A | A | A | T | E | R | L | N | L | T | D | A | L | N | S | N | P | A | G | N | L | Y | D | W | R | S | S | N | S | Y | P | W | T | Q | K | L | N | L | H | L | T | I | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | S | S | S | T | T | S | S | S | T | T | S | S | S | S | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | A | T | G | Q | K | Y | R | I | L | A | S | K | I | V | D | F | N | I | Y | S | N | N | F | N | N | L | V | K | L | E | Q | S | L | G | D | G | V | K | D | H | Y | V | D | I | S | L | D | A | G | Q | Y | V | L | V | M | K | A | N | S | S | Y | S | G | N | Y | P | Y | S | I | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | G | G | G | S | S | S | S | S | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | F | Q | K | F | L | E | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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