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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3alpB_ | PDB header: cell adhesion | Chain: B: PDB Molecule: poliovirus receptor-related protein 1; | PDBTitle: cell adhesion protein |
Added to library: Sat Feb 19 09:27:21 2011 | |
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Sequence | V | Q | V | N | D | S | M | Y | G | F | I | G | T | D | V | V | L | H | C | S | F | A | N | P | L | P | S | V | K | I | T | Q | V | T | W | Q | K | S | T | N | G | S | K | Q | N | V | A | I | Y | N | P | S | M | G | V | S | V | L | A | P | Y | R | E | R | V | E | F | L | R | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | B | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | G | G | G | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | F | T | D | G | T | I | R | L | S | R | L | E | L | E | D | E | G | V | Y | I | C | E | F | A | T | F | P | T | G | N | R | E | S | Q | L | N | L | T | V | M | A | K | P | T | N | W | I | E | G | T | Q | A | V | L | R | A | K | K | G | Q | D | D | K | V | L | V | A | T | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | S | G | G | G | T | T | B | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | S | A | N | G | K | P | P | S | V | V | S | W | E | T | R | L | K | G | E | A | E | Y | Q | E | I | R | N | P | N | G | T | V | T | V | I | S | R | Y | R | L | V | P | S | R | E | A | H | Q | Q | S | L | A | C | I | V | N | Y | H | M | D | R | F | K | E | S | L | T | L | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | S | T | T | S | G | G | G | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | V | Q | Y | E | P | E | V | T | I | E | G | F | D | G | N | W | Y | L | Q | R | M | D | V | K | L | T | C | K | A | D | A | N | P | P | A | T | E | Y | H | W | T | T | L | N | G | S | L | P | K | G | V | E | A | Q | N | R | T | L | F | F | K | G | P | I | N | Y | S | L | A | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | T | T | S | S | T | T | B | S | T | T | T | T | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||
Sequence | T | Y | I | C | E | A | T | N | P | I | G | T | R | S | G | Q | V | E | V | N | I | T | E | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B |
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