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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3ah8A_ | PDB header: signaling protein/inhibitor | Chain: A: PDB Molecule: guanine nucleotide-binding protein g(i) subunit alpha- | PDBTitle: structure of heterotrimeric g protein galpha-q beta gamma in complex2 with an inhibitor ym-254890 |
Added to library: Wed Jan 9 17:22:45 2013 | |
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Sequence | A | E | D | K | A | A | V | E | R | S | K | M | I | D | R | N | L | R | E | D | G | E | R | S | R | R | E | L | K | L | L | L | L | G | T | G | E | S | G | K | S | T | F | I | K | Q | M | R | I | I | H | G | S | G | Y | S | D | E | D | K | R | G | F | T | K | L | V | Y | Q | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S | S | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | F | T | A | M | Q | A | M | I | R | A | M | D | T | L | K | I | P | Y | K | Y | E | H | N | K | A | H | A | Q | L | V | R | E | V | D | V | E | K | V | S | A | F | E | N | P | Y | V | D | A | I | K | S | L | W | N | D | P | G | I | Q | E | C | Y | D | R | R | R | E | Y | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | T | S | S | S | S | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | S | D | S | T | K | Y | Y | L | N | D | L | D | R | V | A | D | P | S | Y | L | P | T | Q | Q | D | V | L | R | V | R | V | P | T | T | G | I | I | E | Y | P | F | D | L | Q | S | V | I | F | R | M | V | D | V | G | G | Q | R | S | E | R | R | K | W | I | H | C | F | E | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T | S | G | G | G | T | G | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | V | T | S | I | M | F | L | V | A | L | S | E | Y | D | Q | V | L | V | E | S | D | N | E | N | R | M | E | E | S | K | A | L | F | R | T | I | I | T | Y | P | W | F | Q | N | S | S | V | I | L | F | L | N | K | K | D | L | L | E | E | K | I | M | Y | S | H | L | V | D | Y | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | G | T | T | T | T | S | G | G | G | T | T | S | T | T | T | S | S | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . |
Sequence | P | E | Y | D | G | P | Q | R | D | A | Q | A | A | R | E | F | I | L | K | M | F | V | D | L | N | P | D | S | D | K | I | I | Y | S | H | F | T | C | A | T | D | T | E | N | I | R | F | V | F | A | A | V | K | D | T | I | L | Q | L | N | L | K | ||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | T | T | S | T | T |
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