|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c3acoB_ | PDB header: endocytosis | Chain: B: PDB Molecule: protein kinase c and casein kinase substrate in | PDBTitle: crystal structure of the efc/f-bar domain of human2 pacsin2/syndapin ii (2.7 a) |
Added to library: Sat Aug 28 17:38:58 2010 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | D | S | F | W | E | V | G | N | Y | K | R | T | V | K | R | I | D | D | G | H | R | L | C | S | D | L | X | N | C | L | H | E | R | A | R | I | E | K | A | Y | A | Q | Q | L | T | E | W | A | R | R | W | R | Q | L | V | E | K | G | P | Q | Y | G | T | V | E | K | A | W | X | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | F | X | S | E | A | E | R | V | S | E | L | H | L | E | V | K | A | S | L | X | N | D | D | F | E | K | I | K | N | W | Q | K | E | A | F | H | K | Q | X | X | G | G | F | K | E | T | K | E | A | E | D | G | F | R | K | A | Q | K | P | W | A | K | K | L | K | E | V | E | A | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | B | S | S | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | K | K | A | H | H | A | A | C | K | E | E | K | L | A | I | S | R | E | A | N | S | K | A | D | P | S | L | N | P | E | Q | L | K | K | L | Q | D | K | I | E | K | C | K | Q | D | V | L | K | T | K | E | K | Y | E | K | S | L | K | E | L | D | Q | G | T | P | Q | Y | X | E | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | G | G | G | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | X | E | Q | V | F | E | Q | C | Q | Q | F | E | E | K | R | L | R | F | F | R | E | V | L | L | E | V | Q | K | H | L | D | L | S | N | V | A | G | Y | K | A | I | Y | H | D | L | E | Q | S | I | R | A | A | D | A | V | E | D | L | R | W | F | R | A | N | H | G | P | G | X | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | X | N | W | P | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|