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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2zfyA_ | PDB header: hydrolase | Chain: A: PDB Molecule: ubiquitin thioesterase otub1; | PDBTitle: crystal structure of human otubain 1 |
Added to library: Tue Mar 16 13:43:22 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | N | P | L | V | S | E | R | L | E | L | S | V | L | Y | K | E | Y | A | E | D | D | N | I | Y | Q | Q | K | I | K | D | L | H | K | K | Y | S | Y | I | R | K | T | R | P | D | G | N | C | F | Y | R | A | F | G | F | S | H | L | E | A | L | L | D | D | S | K | E | L | Q | R | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | G | G | G | G | G | G | G | S | T | T | T | T | T | B | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | A | V | S | A | K | S | K | E | D | L | V | S | Q | G | F | T | E | F | T | I | E | D | F | H | N | T | F | M | D | L | I | E | Q | V | E | K | Q | T | S | V | A | D | L | L | A | S | F | N | D | Q | S | T | S | D | Y | L | V | V | Y | L | R | L | L | T | S | G | Y | L | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | R | E | S | K | F | F | E | H | F | I | E | G | G | R | T | V | K | E | F | C | Q | Q | E | V | E | P | M | C | K | E | S | D | H | I | H | I | I | A | L | A | Q | A | L | S | V | S | I | Q | V | E | Y | M | D | G | E | G | G | T | T | N | P | H | I | F | P | E | G | S | E | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | G | G | G | S | S | T | S | S | T | T | T | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | K | V | Y | L | L | Y | R | P | G | H | Y | D | I | L | Y | K | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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