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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2zbkA_ | PDB header: isomerase | Chain: A: PDB Molecule: type ii dna topoisomerase vi subunit a; | PDBTitle: crystal structure of an intact type ii dna topoisomerase:2 insights into dna transfer mechanisms |
Added to library: Tue Mar 16 13:07:32 2010 | |
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Sequence | D | K | E | A | R | R | K | A | A | N | I | L | R | D | K | F | L | N | L | V | E | Q | L | K | K | G | E | P | L | V | M | E | I | P | M | L | R | R | N | F | L | D | L | N | E | A | K | R | F | M | Q | T | V | L | M | A | S | I | I | Y | D | A | L | V | S | D | E | Y | P | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | R | D | L | Y | Y | R | G | K | H | S | L | L | L | K | S | I | E | E | N | T | W | D | E | Q | K | E | S | D | S | V | I | V | D | I | E | V | F | T | S | L | L | R | E | E | M | L | I | L | S | K | E | K | G | K | V | V | G | N | L | R | I | R | S | G | N | D | V | I | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | T | B | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | S | K | T | G | H | G | A | Y | A | I | E | P | T | P | D | L | I | D | F | I | D | V | D | A | E | F | V | L | V | V | E | K | D | A | V | F | Q | Q | L | H | R | A | G | F | W | K | Q | Y | K | S | I | L | I | T | S | A | G | Q | P | D | R | A | T | R | R | F | V | R | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | B | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | L | N | E | E | L | K | L | P | V | Y | I | L | T | D | A | D | P | Y | G | W | Y | I | F | S | V | F | R | I | G | S | I | S | E | R | L | A | T | P | D | A | K | F | L | G | V | S | M | G | D | I | F | G | N | S | R | K | K | P | Y | L | S | E | A | E | R | K | N | Y | I | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | K | A | K | D | A | D | I | K | R | A | E | E | I | K | N | Y | E | W | F | K | T | K | A | W | Q | E | E | I | N | T | F | L | Q | R | K | A | K | L | E | I | E | A | M | A | S | K | G | L | K | F | L | A | F | Q | Y | I | P | E | K | I | T | N | K | D | Y | I | A | |||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | B |
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